肛門閉鎖是胎兒在發(fā)育過程、胚胎在發(fā)育過程中發(fā)生障礙引起來的,具體的原因不是很清楚。有可能和遺傳或者環(huán)境污染等有一定的關系。孕婦孕期酗酒、抽煙都可能導致肛門閉鎖。有一少半兒是單純的肛腸畸形,還有一部分合并其他畸形。在胚胎發(fā)育時發(fā)育障礙沒有向內(nèi)凹陷形成肛管,直腸發(fā)育正常,在尿道球部或者是陰道下段的附近,還有一部分直腸沒有連接到肛門,但是有瘺管,糞便可以從瘺管里排出來,有可能會出現(xiàn)尿路的感染。這些先天發(fā)育異常,與母親孕期用藥物或者一些遺傳因素有關系?;純撼霈F(xiàn)出生以后沒有排出胎糞,很快就出現(xiàn)嘔吐、腹脹等腸道梗阻的癥狀,一旦確診要及早地進行肛門成形術治療。